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本期目录

  • 生物技术进展
    2025年 第15卷 第1期 发布日期:2025-01-25

进展评述

研究论文

  • 根系木质素含量影响玉米耐盐性的机制研究
  • 张青云, 马蕾, 胥华, 靳礼安, 邹俊杰, 王宝宝, 陈全家, 徐妙云
  • 2025 Vol. 15 (1): 67-77. DOI:10.19586/j.2095-2341.2024.0107
  • 摘要 ( ) HTML ( ) PDF (5038KB)( )
  • 土壤盐度是全球农业生产的主要制约因素,对农业可持续发展和粮食安全造成严重威胁。玉米(Zea mays L.)是我国三大作物之一,而盐碱地是我国极为重要的后备耕地资源。木质素作为植物细胞壁的主要结构成分,研究玉米中木质素的积累及细胞壁增厚对高盐度的响应具有重要意义。选取耐盐玉米自交系(Zhongke4M、Zheng58)和盐敏感玉米自交系(PH4CV、Chang7-2)为研究对象,采用清水对照和200 mmol·L-1 NaCl处理,分析不同盐浓度下玉米根系的形态变化、细胞学特征,检测相关酶活性、木质素含量和基因表达的差异。甲苯胺蓝染色结果表明,耐盐自交系Zhongke4M和Zheng58在盐胁迫下根皮层和内皮层面积的减少明显低于盐敏感玉米自交系PH4CV、Chang7-2。此外,番红荧光观察显示,耐盐自交系在盐胁迫下木质化程度增强或保持稳定,而盐敏感自交系则木质化程度下降。结果表明,耐盐自交系Zhongke4M和Zheng58在盐胁迫下木质素含量稳定,而盐敏感自交系显著降低。酶活性分析显示,盐胁迫下苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonialyase,PAL)和肉桂醇脱氢酶(cinnamyl alcohd dehydrogenase,CAD)在盐敏感自交系中活性降低,而肉桂酸4-羟化酶(cinnamic acid 4-hydroxylase,C4H)在耐盐自交系中活性上升。RNA-seq分析确定了3个与木质素合成相关的基因,其在不同玉米品种中的表达量存在差异。研究结果为深入理解玉米通过调节木质素积累和细胞壁结构应对盐胁迫提供了新视角,有助于揭示玉米的耐盐机制。

  • 基于衰老相关基因特征的胰腺癌风险分层及预后预测模型
  • 李新雄, 洪伟煊, 冯添顺, 房俊伟, 赵虎, 肖春红, 王梅平
  • 2025 Vol. 15 (1): 158-169. DOI:10.19586/j.2095-2341.2024.0027
  • 摘要 ( ) HTML ( ) PDF (9364KB)( )
  • 为鉴定出胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma,PAAD)患者中有预后意义的衰老相关长链非编码RNA(long noncoding RNAs,lncRNA),基于衰老相关基因(aging-related gene,ARG)构建预后预测模型。从癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas Database,TCGA)、基因型组织表达数据库(Genotypic Tissue Expression Database,GTEX)获取PAAD和正常样本的转录组信息,相关性分析筛选出ARG中具有显著相关性的lncRNA。通过差异分析、单因素回归、Lasso回归和多因素回归鉴定出目标lncRNA,并构建出PAAD预后风险模型。研究共鉴定出1 109个衰老相关的lncRNA,筛选后最终获得9个lncRNA构建风险评分预后模型,包括AC245041.2、AC244153.1、AC091057.1、MIR3142HG、AL137779.2、AC145207.5、TDRKH-AS1、AC068620.2和AC127024.6。模型的ROC(receiver operating curve)曲线和曲线下AUC(area under the curve)达到0.798。根据风险中值分为高风险组和低风险组,Kaplan-Meier分析两组总体生存期(overall survival,OS)具有显著差异,将风险评分和临床病理特征结合,多因素Cox回归分析风险评分(HR:1.136,95%CI:1.090~1.183)、年龄(HR:1.021,95%CI:1.000~1.042)是预后独立因素,并构建出PAAD预后评估的列线图。进一步,免疫学相关分析揭示了高低风险组存在免疫浸润的差异以及免疫检查点基因的表达差异,模型的预测特征与免疫状态相关。研究基于9个衰老相关lncRNA构建了PAAD预后模型,有助于改善PAAD患者预后管理。