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本期目录

  • 生物技术进展
    2025年 第15卷 第3期 发布日期:2025-05-25

进展评述

研究论文

  • 联合GWAS和转录组分析挖掘与白斑狗鱼耐高温性状关联的SNP
  • 海萨·艾也力汗null, 焦飞, 刘鸿, 呼德拉提·阿那斯null, 沈玉帮
  • 2025 Vol. 15 (3): 432-445. DOI:10.19586/j.2095-2341.2024.0184
  • 摘要 ( ) HTML ( ) PDF (10611KB)( )
  • 研究旨在提升白斑狗鱼对极端高温的适应能力和满足向南部温暖地区养殖发展的需求,进一步发掘与其耐高温性状显著关联的基因位点和候选基因。首先基于前期对热敏感与耐高温群体的简化基因组测序数据,利用混合线性模型(mixed-linear model, MLM)进行全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)筛选出与耐高温性状显著关联的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点;继而采用转录组测序技术对4组不同热处理幼鱼的脑组织进行基因差异表达分析;随后联合GWAS和转录组分析筛选出候选基因和SNP位点;最后利用Sanger测序技术,以耐高温组和参考组为材料,对显著关联的SNP位点加以验证。结果显示,GWAS分析获得了471个与耐高温性状显著关联的SNP位点。GO和KEGG分析显示,DEGs显著富集于内质网应激和免疫系统相关通路。GSEA分析显示,热胁迫84 h后先天免疫反应被激活,并且与NAD(+)ADP-核糖基转移酶活性相关的基因被诱导。先天免疫反应启动和调控相关基因的PPI分析显示,parp14parp9stat1stat3是核心基因,同时也是互作基因。热应激反应中parp14可能通过调控stat1stat3等下游效应基因来发挥保护细胞的作用。GWAS获得的SNP位点中,有2个SNP位点位于parp14基因的第三外显子。验证结果显示,parp14基因第三外显子中的2个SNP位点与耐高温性状显著相关,且为完全连锁不平衡,其中位点rsc.646T>C为错义突变,位点rsc.777G>A为同义突变。研究筛选出与白斑狗鱼耐高温相关的候选基因及与耐高温性状显著关联的2个SNP位点,可为白斑狗鱼耐高温性状的遗传机制和分子标记辅助育种提供理论依据。

  • 冠突曲霉菌发酵枸杞叶红茶的抗氧化活性及成分变化
  • 陈菊, 丁纯洁, 孙银玲, 赵娢, 郑宏宇, 高辛, 金书含, 董坤
  • 2025 Vol. 15 (3): 510-517. DOI:10.19586/j.2095-2341.2025.0005
  • 摘要 ( ) HTML ( ) PDF (1326KB)( )
  • 为了探究冠突曲霉菌(Aspergillus cristatum)发酵枸杞叶过程中,枸杞叶的活性成分变化及其对体外抗氧化活性的影响,采集福建漳州(FZ)、广东清远(GQ)、江苏南通(JN)3个产地的枸杞叶(GY),按照红茶工艺,经过萎凋、揉捻、自然发酵制成枸杞叶红茶(GC),接种冠突曲霉菌发酵2 d,获得冠突曲霉菌发酵的枸杞叶(GCF)。结果发现,与枸杞叶相比,冠突曲霉菌发酵枸杞叶红茶可以改善枸杞叶的口感,去除青草味;茶汤颜色加深,由橙黄色变为橙红色;多酚、类胡萝卜素含量无显著变化;黄酮含量显著降低,其中JNGCF黄酮含量降低幅度最小,下降了43.44%;与各组GY相比,FZGCF、GQGCF、JNGCF的蛋白质、总多糖和总游离氨基酸含量均显著升高。其中,蛋白质分别升高了50.70%、49.07%、55.34%;总多糖分别升高了98.93%、113.15%、100.42%;总游离氨基酸分别升高了75.90%、82.38%、68.84%。体外抗氧化活性实验中,FZGCF的DPPH自由基清除率显著降低,GQGCF、JNGCF与各自GY组无显著差异,且FZGCF、GQGCF、JNGCF的还原力均显著下降。结果表明,冠突曲霉菌发酵枸杞叶能改善口感,增加茶汤红度,能较大程度保留枸杞叶原有的抗氧化活性物质多酚和类胡萝卜素,并且增加营养物质如蛋白质、多糖和氨基酸的含量。以上结果为枸杞叶功能性产品开发提供了一定理论基础,填补了枸杞叶红茶产品的空白,降低了枸杞副产物枸杞叶的资源废弃率。