基于16S rRNA基因文库技术分析水性涂料菌群的多样性

doi:10.3969/j.issn.2095-2341.2016.04.13

生物技术进展 ›› 2016, Vol. 6 ›› Issue (4): 295-298.DOI: 10.3969/j.issn.2095-2341.2016.04.13

基于16S rRNA基因文库技术分析水性涂料菌群的多样性

黄小茉1,2,陶宏兵1,邱晓颖2,李良秋1,施庆珊1

1.广东省微生物研究所, 华南应用微生物国家重点实验室; 广东省菌种保藏与应用重点实验室, 广州 510070;

2.广东迪美生物技术有限公司, 广州 510663

收稿日期:2016-04-29 出版日期:2016-07-25 发布日期:2016-06-22
作者简介:黄小茉，高级工程师，研究方向为工业产品微生物危害防治。Tel：020-87137503;E-mail：molyhuang@21cn.com
基金资助:
广东省科技计划项目（2013B090600148; 2013B050800023）;揭阳市产学研结合项目(201429)资助。

Analysis of Waterborne Coating Bacterial Diversity by the 16S rRNA Gene Library

HUANG Xiao-mo, TAO Hong-bing, QIU Xiao-ying, LI Liang-qiu, SHI Qing-shan

1.State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China; Guangdong Provincial Key Laboratory of

Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou 510070, China;

2.Guangdong Demay Biological Technology Co., Ltd, Guangzhou 510663, China

Received:2016-04-29 Online:2016-07-25 Published:2016-06-22

摘要/Abstract

摘要： 采用未培养技术直接提取变质涂料微生物总DNA，使用通用引物进行PCR扩增、纯化、连接、克隆和测序，建立16S rRNA基因文库，分析变质水性涂料细菌的数量与种类。从96个克隆子中共检测到8种不同种属的细菌，假单胞菌属(Pseudomonas)为优势菌群，占总数的75%，软骨酸芽孢杆菌(Paenibacillus chondroitinus)占总数的15%，此外豚鼠气单胞菌(Aeromonas caviae)和粪产碱杆菌(Alcaligenes faecalis)分别占总数2%。结果表明16S rRNA基因文库是一种较好的研究水性涂料细菌群落多样性的方法。

关键词: 水性涂料, 16S rRNA, 细菌, 多样性

Abstract: Total microbial DNA was directly extracted from a metamorphic waterborne coating, the clone library of 16S ribosomal RNA genes was amplified using PCR with universal bacterial primer sets. The PCR products were then subcloned into pGEM-T vector, amplified DNA was used for diversity analysis. The total of 96 clones were selected and 8 kinds of microbe which were used for sequencing. Pseudomonas was the most one (75% of total clones), then was Paenibacillus chondroitinus (15% of total clones), Aeromonas caviae and Alcaligenes faecalis accounted for 2% of total clones respectively. 16S rRNA gene library is a good research method for waterborne bacteria community diversity analysis.

Key words: waterborne coating, 16S rRNA, bacterial, diversity

黄小茉,陶宏兵,邱晓颖,李良秋,施庆珊. 基于16S rRNA基因文库技术分析水性涂料菌群的多样性[J]. 生物技术进展, 2016, 6(4): 295-298.

HUANG Xiao-mo1,2, TAO Hong-bing1, QIU Xiao-ying2, LI Liang-qiu1, SHI Qing-shan1. Analysis of Waterborne Coating Bacterial Diversity by the 16S rRNA Gene Library[J]. Curr. Biotech., 2016, 6(4): 295-298.

[1]	高勤学, 杨文科, 蒙永刚, 牙生江·纳斯尔, 买买提吐尔干·库瓦西. 新疆克孜勒苏柯尔克孜地区帕米尔牦牛mtDNA COⅠ 的遗传多样性分析[J]. 生物技术进展, 2022, 12(4): 568-576.
[2]	张文静, 佟晔, 杨锡文, 曹彦金, 魏计东. 高产中性蛋白酶菌株的筛选、优化及中试放大[J]. 生物技术进展, 2022, 12(1): 112-119.
[3]	靳涛,田杨,全言钊,李明亮,严安心,李璐瑶. 铜川汉族人群38个Y-STR基因座多态性调查[J]. 生物技术进展, 2021, 11(2): 223-230.
[4]	樊英,于晓清,李乐,王晓璐,叶海斌,胡发文,刁菁,刘洪军. 基于16S rRNA高通量测序分析大泷六线鱼表皮粘液及肠道内容物微生物多样性[J]. 生物技术进展, 2021, 11(1): 79-90.
[5]	杨苑,郭永福,唐浩智,张彪,史龚林,汪娅婷,杨俊,魏兰芳. 云南芒果采后炭疽病病原菌的鉴定及室内生防菌的筛选[J]. 生物技术进展, 2020, 10(4): 371-377.
[6]	刘铭，刘辉，李娜，陈潇，胡光春，刘岚铮. 应用高通量测序技术对我国东海带鱼肠道菌群的研究[J]. 生物技术进展, 2020, 10(2): 152-157.
[7]	李静,王莉,道敏,胡平,肖逸,韩建林,王玉涛. 喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛mtDNA Cytb遗传多样性及系统发育分析[J]. 生物技术进展, 2019, 9(5): 509-517.
[8]	陈霞,夏晨梅,戴再友,李倩倩,金玲肖,林佩丽,张忠臣,钟海兵,颜海帆,王国平,戴丽,钟玉芬,吴忠标4. 十二指肠溃疡中幽门螺杆菌定植与菌群结构的关系[J]. 生物技术进展, 2019, 9(5): 536-542.
[9]	马永凯,陶宏兵,李文茹,谢小保,施庆珊,周少璐. 水性涂料中微生物群落结构及其多样性分析[J]. 生物技术进展, 2019, 9(4): 396-403.
[10]	赵彭年,杨德玉,王加友,丁一凡,安鹏,王远. 一株亚硝化细菌的分离鉴定及其发酵工艺优化[J]. 生物技术进展, 2019, 9(1): 69-77.
[11]	邹卫玲,冯广达,李华平,朱红惠. 废弃铅锌矿石和钨矿砂中可培养细菌多样性分析[J]. 生物技术进展, 2018, 8(5): 450-458.
[12]	张鲜姣,吕颖颖,朱红惠. 湿地环境可培养粘细菌多样性研究[J]. 生物技术进展, 2018, 8(2): 140-146.
[13]	张鲜姣,吕颖颖,朱红惠. 越南原始森林粘细菌的分离与鉴定[J]. 生物技术进展, 2018, 8(2): 147-152.
[14]	张小芳,艾瑛,魏兰芳,史恭林,王星,李凡,姬广海. 生防细菌对水稻的促生性及诱导抗性研究[J]. 生物技术进展, 2017, 7(1): 43-51.
[15]	张志明,汤才国,杨三维,乔麟轶,常建忠,赵翠荣4,5,郑军. 小麦(Triticum aestivum L.)野生资源的发掘、利用研究进展[J]. 生物技术进展, 2016, 6(5): 305-311.

基于16S rRNA基因文库技术分析水性涂料菌群的多样性

Analysis of Waterborne Coating Bacterial Diversity by the 16S rRNA Gene Library

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