本期目录
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生物技术进展
2013年 第3卷 第4期
发布日期:2013-07-25
进展评述
研究论文
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苏云金芽胞杆菌中aiiA基因密码子偏好性分析
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曾世涌,苏小惠,谢盼盼,毛惠民,杨梅
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2013 Vol. 3 (4):
257-263.
DOI:10.3969/j.issn.2095-2341.2013.0 .
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摘要 (
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aiiA基因指导表达的AiiA蛋白是一类能水解细菌群体感应信号分子内酯键的内酯酶。本研究使用CodonW、CUSP和CHIPS等相关程序对苏云金芽胞杆菌中aiiA基因的密码子使用情况进行分析,比较了aiiA基因与大肠杆菌、苏云金芽胞杆菌、枯草芽胞杆菌以及毕赤酵母的密码子偏好性。结果表明,aiiA基因偏好使用以A、T结尾的密码子;aiiA基因的密码子用法与大肠杆菌、苏云金芽胞杆菌、枯草芽胞杆菌和毕赤酵母的基因组密码子用法都有不同程度的偏好差异,其中与毕赤酵母的密码子用法差异最大;比较了aiiA基因分别以苏云金芽胞杆菌、大肠杆菌、枯草芽胞杆菌及毕赤酵母为宿主时密码子使用频率,发现都含有不同程度的低频密码子聚集现象,如果要在上述几种表达系统中实现aiiA基因的高效表达则需对aiiA基因的部分密码子进行优化改造。
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一株普鲁兰酶产生菌的筛选及其基因克隆和酶学特性研究
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王培立,初晓宇,伍宁丰
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2013 Vol. 3 (4):
264-269.
DOI:10.3969/j.issn.2095-2341.2013.04.07
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摘要 (
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(2183KB)(
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普鲁兰酶作为一种解支酶,能够特异地作用于多糖中的α-1,6糖苷键,将淀粉中高度分支的支链淀粉转变成直链淀粉。本文通过以普鲁兰糖为唯一碳源的功能平板筛选方法,从云南腾冲温泉淤泥中分离到1株产普鲁兰酶的菌株73号,经16S rDNA序列分析,该菌属于厌氧芽胞杆菌属(Anoxybacillus sp.)。通过普鲁兰酶的保守区片段扩增及序列比对,最终从该菌中克隆得到普鲁兰酶编码基因pul73,全长2 121 bp,编码706个氨基酸。将该基因在大肠杆菌BL21(DE3)中进行异源表达和纯化,获得酶蛋白Pul73最适温度50℃,最适pH 6.0,在65℃有较好的热稳定性,保温30 min后仍有72%的剩余酶活。50℃时Pul73对普鲁兰糖的Km为1.643 mg/mL,其最大反应速度Vmax为1.34 U/mg,kcat为535.8/s。
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木霉W2固态发酵产羧甲基纤维素酶的研究
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任红梅,刘左军,伍国强,单夕文
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2013 Vol. 3 (4):
270-276.
DOI:10.3969/j.issn.2095-2341.2013.0 .
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摘要 (
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从湖北地区棉花地采样,筛选分离出一株纤维素分解菌株W2,根据形态及18S rDNA序列分析,初步鉴定为木霉属。以玉米芯为发酵原料,对W2固态发酵(SSF)产羧甲基纤维素酶(CMCase)的条件进行优化。选取发酵时间、温度、基质含水量和初始pH为自变量,以CMCase活力为响应值,采用BoxBenhnken中心组合设计和响应面分析法,研究了各变量及其交互作用对CMcase的影响,建立了二次多项式回归方程及响应面图。结合单因素试验,确定了适宜的发酵条件为:温度25℃,基质含水量63%,初始pH 6.0,发酵65 h,CMCase活力达到最大。最后,在适宜的固态发酵曲中,加入活化酵母细胞,采用改良Conway法测定发酵曲中酒精的含量,达0.38 mg/mL。
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新疆阿克苏盐碱地土壤细菌的分离研究
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李良秋,郑贺云,蔡卓平,姚青,朱红惠
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2013 Vol. 3 (4):
281-287.
DOI:10.3969/j.issn.2095-2341.2013.04.10
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摘要 (
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为从可培养层面了解新疆塔里木盆地盐碱地土壤中的细菌资源多样性,本研究共分离和培养盐碱地土壤中的细菌103株。16S rDNA基因序列系统发育分析表明,这些株菌分别属于芽胞杆菌属(Bacillus)等31个属。盐碱地土壤环境中的优势菌群是Bacillus, Streptomyces, Micrococcus, Kocuria和Paracoccus,分别占总菌株数的36.27%、10.8%、6.9%、6.9%和3.9%。其中5株菌的16S rDNA基因序列与已有效发表菌株的序列相似性小于97%,表明它们可能是新的细菌分类单元。研究表明新疆阿克苏地区盐碱地土壤中具有丰富的微生物资源,为盐碱地微生物资源的开发提供重要的理论依据。
技术与方法
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F0F1-ATPase分子马达技术对阪崎肠杆菌检测的研究
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张捷,王煜,陆琳,刘艳华,周琦,孙梓晏,顾德周,尚世进,张惠媛,王佩荣,陈广全,乐加昌
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2013 Vol. 3 (4):
297-300.
DOI:10.3969/j.issn.2095-2341.2013.0 .
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摘要 (
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PDF
(1391KB)(
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本研究建立了应用F0F1-ATPase分子马达生物传感器快速检测阪崎肠杆菌的方法。自嗜热菌中提取载色体后,合成针对阪崎肠杆菌的生物素化ITS探针,在载色体ATP合酶的ε亚基上连接ε亚基抗体-生物素-链霉亲和素-生物素-ITS探针,将待测阪崎肠杆菌标准菌株和阴性对照分别与此生物传感器结合,比较其催化ATP产生量,进而对阪崎肠杆菌DNA进行检测。结果表明,chro ITS探针浓度0.019 mg/mL,阪崎肠杆菌DNA浓度40 ng/mL为最适检测条件。通过与传统检测方法及PCR检测方法对照,本方法具有良好的检测符合性。