生物技术进展 ›› 2012, Vol. 2 ›› Issue (1): 52-56.DOI: 10.3969/j.issn.2095-2341.2012.01.10
吴一雷1, 闫鹏程1,刘充1,陈禹保1,赵文明2
WU Yi-lei, YAN Peng-cheng, LIU Chong, CHEN Yu-bao, ZHAO Wen-ming
摘要: 高通量RNA测序(RNA-seq)技术为研究人员提供了海量数据,如何对这些数据进行快速有效的分析,并为后续转录组、基因表达等研究提供支持,是生物信息学领域的热点方向。本文讨论了当前RNA-seq数据分析的发展水平和常用软件、算法,并设计了一系列数据处理模块和分析流程。同时,为了给用户提供更好的使用环境,我们设计了基于弹性资源管理系统的生物云平台BioCloud。该平台集成了丰富的软件,采用高灵活度、高扩展性的体系架构,在给用户提供低成本、高性能计算服务的同时,还提供个性化的流程定制服务。