生物技术进展 ›› 2019, Vol. 9 ›› Issue (5): 490-501.DOI: 10.19586/j.2095-2341.2019.0043
高正银,孙文杰,宋晓云,胡轼,左开井*
GAO Zhengyin, SUN Wenjie, SONG Xiaoyun, HU Shi, ZUO Kaijing
摘要: 第Ⅲ类过氧化物酶(Class Ⅲ Peroxidases,Prxs)是植物特有的过氧化物酶家族,存在于植物细胞外空间或液泡中,参与了植物抗逆和生长发育等多个过程。为了分析过氧化物酶基因在棉花纤维发育过程中的功能,利用蛋白保守结构域分析方法,对雷蒙德棉(D组)第Ⅲ类过氧化物酶家族基因进行了全基因组鉴定,确定了90个第Ⅲ类过氧化物酶基因。进一步根据聚类分析、基因结构分析和蛋白亚细胞定位分析结果将雷蒙德棉第Ⅲ类过氧化物酶划分成8个亚类。最后,结合转录组数据和qRT-PCR对基因的表达模式进行了分析,获得了在棉花纤维不同发育阶段高水平表达的候选基因GrPrx11和GrPrx3、GrPrx21和GrPrx77。这些特异性高表达基因的鉴定为深入研究过氧化物酶基因在纤维发育中的功能奠定了一定的基础。